Sólo añadiendo dos metas, conseguimos que salga el típico banner de app.
Añadimos los metas en el head de la web.
... ...
Para Apple:
Si queremos pasarle más argumentos, podemos visitar las guías de apple:
https://developer.apple.com/library/ios/documentation/AppleApplications/Reference/SafariWebContent/PromotingAppswithAppBanners/PromotingAppswithAppBanners.html
Para Android: